姓名：薑寧
職稱：副教授
辦公電話：021-31246712
電子郵箱：ningjiang@fudan.edu.cn
辦公地點：江灣校區万博体育分
G605室
個人信息簡介
男，1983年11月出生，計算基因組學博士，万博英超狼队网官方网 計算生物學係副教授，碩士研究生導師。2001-2005年就讀山東大學本科，2006-2013年在英國伯明翰大學万博体育分 攻讀研究生，2008年獲碩士學位，2013年獲計算基因組學博士學位。2013年5月到万博英超狼队网官方网 任教，先後任師資博士後、青年副研究員、副教授。自2014年起負責承擔了國家自然科學基金青年項目、麵上項目、衛健委、教育部專項等課題共10項，並以課題骨幹參與一項國家科技部‘973’項目，兩項國家十三五重大研發計劃項目，一項國家十四五重大研發計劃項目；已在Developmental Cell、PNAS、Leukemia、Nature Communications、Nucleic Acids Research等國際學術專業期刊發表SCI論文20餘篇。
主要研究方向
基於二代和三代高通量測序組學大數據的信號處理，數據分析和信息挖掘的方法學和應用研究，通過整合基因組、轉錄組，表觀基因組以及單細胞組學等多維度的組學大數據和臨床表型組數據信息，圍繞複雜性狀表型和人類疾病表型解析其發生、發展中的遺傳機製，並開發新的方法學和分析流程。目前，已成功開發出具有獨立自主知識產權的簡化基因組測序及分析平台、複雜疾病易感基因篩查分析平台、孟德爾遺傳疾病PANEL檢測分析篩查平台、腫瘤新生抗原分析預測算法平台，上述分析檢測技術平台已經在狗万外围充值 附屬華山醫院、上海市公共衛生臨床中心等醫院廣泛應用於臨床和科研。
授課情況
承擔本科生和研究生課程：《基因組學和生物信息學》《微陣列芯片和高通量組學數據分析與應用》，《組學數據的統計分析和挖掘》，《生物信息學》課程的教學工作。
招生專業
計算生物學，生物信息學，疾病遺傳信息分析
近3年代表性成果（2019.06-2022.06）
1.Sun S, Jiang Y, Zhang Q, Pan H, Li X, Yang L, Huang M, Wei W, Wang X, Qiu M, Cao L, He H, Yu M, Liu H, Zhao B*, Jiang N*, Li R*, Lin X*. (2022) Znhit1 controls meiotic initiation in male germ cells by coordinating with Stra8 to activate meiotic gene expression. Developmental Cell. 2022 Apr 11;57(7):901-913.e4. doi: 10.1016/j.devcel.2022.03.006. (並列通訊作者)
2.Zhang Y#, Jiang N#, Qi W#, Li T#, Zhang Y, Zhang H, Wu J, Zhu Z, Ai J, Qiu C, Zhang W. (2022) Intra-host SARS-CoV-2 single-nucleotide variants emerged during the early stage of COVID-19 pandemic forecast population fixing mutations. Journal of Infection. 2022 May;84(5):722-746. doi: 10.1016/j.jinf.2022.01.016. (並列第一作者)
3.Ruan QL#, Yang QL#, Gao YX#, Wu J, Lin SR, Zhou JY, Shao LY, Wang S, Liu QQ, Gao Y, Jiang N*, Zhang WH*. (2021) Transcriptional Signatures of Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Can Identify the Risk of Tuberculosis Progression from Latent Infection among Individuals with Silicosis. Emerg Microbes Infect. 2021 May 27:1-24. doi: 10.1080/22221751.2021.1915184. Online ahead of print. (並列通訊作者)
4.Ai J#, Zhang H#, Zhou Z#, Weng S#, Huang H#, Wang S, Shao L, Gao Y, Wu J, Ruan Q, Wang F, Jiang N*, Chen J*, Zhang W. (2021) Gene expression pattern analysis using dual-color RT-MLPA and integrative genome-wide association studies of eQTL for tuberculosis suscepitibility. Respiratory Research. 2021 Jan 20;22(1):23. doi: 10.1186/s12931-020-01612-9. (並列通訊作者)
5.Sun S#, Jiang N#, Jiang Y, He Q, He H, Wang X, Yang L, Li R, Liu F, Lin X*, Zhao B*. (2020) Chromatin Remodeler Znhit1 Preserves Hematopoietic Stem Cell Quiescence by Determining the Accessibility of Distal Enhancers. Leukemia. 2020. 2020-07-21, doi: 10.1038/s41375-020-0988-5.(並列第一作者)
6.Pan H#, Jiang N#, Sun S, Jiang H, Xu J, Jiang X, Gao Q, Li L, Wu H, Zheng H, Qi Q, Li T, Zhang M, Zhang L, Wan X, Lin X, Wong J, Shi Q*, Li R*. (2020) UHRF1-repressed 5'-hydroxymethylcytosine is essential for the male meiotic prophase I. Cell Death Diseases. 2020 Feb 21;11(2):142. doi: 10.1038/s41419- 020-2333-3. (並列第一作者)
7.Gao S#, Wang J#, Jiang N#, Zhang S, Wang Y, Zhang J, Li N, Fang Y, Yang L, Chen S, Yan B, Huang T, Kuai B, Wang Y, Chang F, Ren G*. (2020) Hyponastic Leaves 1 Protects pri-miRNAs From Nuclear Exosome Attack. Proc Natl Acad Sci USA. 2020 Jul 7;202007203. doi: 10.1073/pnas.2007203117.(並列第一作者)
8.Zhao B#*, Chen Y#, Jiang N#, Yang L, Sun S, Zhang Y, Wen Z, Ray L, Liu H, Hou G, Lin X*. (2019) Znhit1 controls intestinal stem cell maintenance by regulating H2A.Z incorporation, Nature Communications, 2019, 10:1071. doi.org /10.1038/s41467-019-0906.(並列第一作者)
9.Wang J#, Chen S#, Jiang N#, Li N, Wang X, Li Z, Li X, Liu H, Li L, Yang Y, Ni T, Yu C, Ma J, Zheng B, Ren G*. (2019) Spliceosome disassembly factors ILP1 and NTR1 promote miRNA biogenesis in Arabidopsis thaliana.Nucleic Acids Research. 2019 Jun 19. doi: 10.1093/nar/gkz526. (並列第一作者)
10.Xu J#, Wu J#, Teng X, Cai L, Yuan H, Chen X, Hu M, Wang X, Jiang N*, Chen H*.(2020) Large duplication in LMBR1 gene in a large Chinese pedigree with triphalangeal thumb polysyndactyly syndrome. Am J Med Genet A. 2020 Sep;182(9): 2117-2123.(並列通訊作者)
11.Chen C, Zhang Y, Yu S, Zhou Y, Yang S, Jin J, Chen S, Cui P, Wu J*, Jiang N*, Zhang W*. (2019) Tracking Carbapenem-Producing Klebsiella pneumoniae Outbreak in an Intensive Care Unit by Whole Genome Sequencing. Front Cell Infect Microbiol. 2019 Aug 8;9:281.(並列通訊作者)
12.Lessons From the Misdiagnosis of Cryopyrin-Associated Periodic Syndrome as an Infection: Importance of an Early and Precise Diagnosis. J Clin Rheumatol. 2019 Sep 12. doi: 10.1097/RHU.0000000000001179.(通訊作者)
13.Mei J, Jiang N*, Ren G*. (2019) The F-box protein HAWAIIAN SKIRT is required for mimicry target induced microRNA degradation in Arabidopsis. J Integr Plant Biol, 2019 Nov;61(11):1121-1127. doi: 10.1111/jipb.12761.(並列通訊作者)