2020年，膀胱癌全球新發573,278例，死亡212,536例。膀胱癌最常見的組織類型是尿路上皮癌，約占90%，按照浸潤特征又可以分為肌肉浸潤膀胱癌（75%）和非肌肉浸潤膀胱癌（25%）。非肌肉浸潤膀胱癌的特點是容易複發，並且會進展浸潤。肌肉浸潤膀胱癌的特點是五年生存率低和容易轉移。目前膀胱癌的治療主要包括膀胱電切術、放化療、靶向和免疫治療。PD-1和PD-L1也已經被批準應用於膀胱癌的治療，但是對於膀胱尿路上皮癌可靶向的突變基因是比較有限的。另外膀胱尿路上皮癌的分型主要集中在mRNA的層麵上，還缺少對膀胱尿路上皮癌蛋白層麵上的分型分析。目前還沒有膀胱尿路上皮癌的多組學研究。
基於此，万博英超狼队网官方网 丁琛團隊、狗万外围充值 附屬中山醫院侯英勇團隊、狗万外围充值 附屬中山醫院郭劍明團隊、狗万外围充值 附屬腫瘤醫院葉定偉團隊和上海交通大學附屬新華醫院趙健元團隊聯合對116例中國膀胱尿路上皮癌患者進行了蛋白組，基因組，轉錄組和磷酸化組測序分析（圖1A-B），並結合患者的臨床病理特征，既往病史，生存情況進行整合分析。相關研究成果以“膀胱尿路上皮癌蛋白基因組學特征” (Integrated proteogenomic characterization of urothelial carcinoma of the bladder) 為題，於北京時間2022年6月4日下午在線發表於最新一期《Journal of Hematology & Oncology》雜誌上。
本研究通過大隊列樣本描繪了中國人群的膀胱尿路上皮癌多組學圖譜。基因組鑒定到了膀胱癌中常見的突變，如TP53、 KMT2D、 PIK3CA和 FGFR3等（圖1C-D）。腫瘤和形態學正常的尿路上皮對比的多組學分析發現，腫瘤組織高表達的細胞周期和細胞粘附通路，形態學正常的尿路上皮中高表達的通路有上皮細胞分化和跨膜轉運。蛋白分型顯示鑒定到U-I、U-II和U-III三個亞型（圖1E），U-III生存最差(圖1F)，代表性的通路有PI3K-Akt通路、血小板激活和細胞外基質（圖1G）。U-I生存最好，代表性的通路有花生四烯酸代謝、丙酸代謝等。將蛋白分型與以往的mRNA分型比較顯示具有很多高的一致性（圖1H）。KSEA分析得到了蛋白三型各自的激酶特征（圖1I）。另外利用WGCNA分析，找到了和生存相關的Module，並從中找到腫瘤中高表達並和生存相關的GARS，分子功能驗證實驗表明GARS可以通過抑製PGK1和PKM2的活性從而促進磷酸戊糖途徑。
A.多組學分析示意圖; B. 116例患者的測序情況; C. 基因組突變情況; D. 多隊列突變頻率對比; E. 蛋白分型; F. 蛋白分型OS和PFS; G. 蛋白亞型的差異通路; H. 與以往分型對比; I. 蛋白三型各自的激酶情況。
這一成果描繪了中國人群的膀胱尿路上皮癌的蛋白基因組表達譜，發現了腫瘤特異性通路和激酶。利用蛋白組數據進行分子分型，並發現了每個分子分型特異性的激酶。對非肌肉浸潤膀胱癌和肌肉浸潤膀胱癌的整合分析發現了5p驅動非肌肉浸潤膀胱癌浸潤的潛在機製。另外，該研究還描繪了膀胱尿路上皮癌免疫分型的特征。此研究為膀胱尿路上皮癌的發生發展機製和精準治療提供了新的依據。
狗万外围充值 生科院/表型組研究院徐寧、姚珍梅、狗万外围充值 附屬中山醫院尚果果、王海星、狗万外围充值 附屬腫瘤醫院葉定偉、張海梁、瞿元元為本文共同第一作者，万博英超狼队网官方网 丁琛教授、狗万外围充值 附屬中山醫院侯英勇教授、郭劍明教授為本文共同通訊作者。狗万外围充值 附屬腫瘤醫院葉定偉教授、張海梁教授、狗万外围充值 附屬中山醫院侯君教授和上海交通大學附屬新華醫院趙健元教授參與了本研究的指導工作。
本研究受到上海市級科技重大專項“國際人類表型組計劃（一期）”、科技部重點研發計劃、國家自然科學基金麵上項目和重點項目、上海市自然科學基金、中國博士後科學基金等項目的資助與支持。
原文鏈接：
https://jhoonline.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13045-022-01291-7